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为提高全国各级疾控机构早期发现和识别传染病暴发、流行的能力，中国疾病预防控制中心研发、试点和完善了“传染病自动预警（时间模型）信息系统”，并在此基础上初步开发完成了“传染病自动预警（时空模型）信息系统”。经与卫生部应急办研究，于2008年4月21日在全国正式启动传染病自动预警（时间模型）试运行工作，同时在08奥运赛事举办城市、计划单列市以及试点省份的215个县（区）开展传染病自动预警（时空模型）试点工作。
“传染病自动预警信息系统”是“中国疾病预防控制信息系统”平台中新建的一套专用于传染病自动预警的信息系统。该系统以县（区）为单位，利用传染病疫情监测报告数据建立数据库，采用时间/时空预警模型每日自动运算，将探测到的病例异常增加或聚集的信号，以手机短信的方式自动发送给各级疾控机构疫情值班人员，提醒其及时关注和处理。目前系统共设置了29种预警传染病，并对鼠疫、霍乱、SARS、脊髓灰质炎、人感染高致病性禽流感、肺炭疽及不明原因肺炎等重点传染病，采用单病例实时预警。
该项工作的启动是首次在全国范围内实现传染病自动预警，将既往的研究成果转化为可直接利用的资源，并进一步加强了对传染病疫情监测报告数据的分析与利用。同时在部分地区开展传染病自动预警（时空模型）试点工作，进一步采用时间-空间聚集性探测技术，利用病例的现住址信息，发现可能存在的病例聚集，深入传染病预警研究工作。
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